Antibodi bispesifik yang sangat kuat menetralkan varian SARS-CoV-2 yang menjadi perhatian

• Studi Science Translational Medicine pada 5 Maret 2025 mengevaluasi strategi antibodi yang menargetkan NTD dan RBD pada spike SARS-CoV-2 secara bersamaan agar dapat bertahan terhadap penghindaran oleh varian
• Pada awal pandemi, terapi antibodi monoklonal berguna, tetapi efektivitasnya melemah ketika varian yang menjadi perhatian terutama menghindari ikatan antibodi melalui mutasi RBD
• Antibodi C1596 yang berasal dari pasien yang pulih dari COVID-19 menunjukkan ikatan luas terhadap berbagai varian yang menjadi perhatian, dan mengenali epitope terpisah di luar antigenic supersite site i pada NTD
• Antibodi bispesifik berbasis C1596, CoV2-biRN5 dan CoV2-biRN7, mempertahankan aktivitas netralisasi in vitro yang kuat di seluruh varian Omicron yang diuji, termasuk XBB.1.5, BA.2.86, dan JN.1
• Pemberian profilaksis CoV2-biRN5 menurunkan beban virus di paru-paru setelah challenge SARS-CoV-2 XBB.1.5 pada tikus K18-hACE2, mendukung potensi desain antibodi penargetan ganda NTD-RBD

---

Desain antibodi yang menargetkan penghindaran RBD

• Pertanyaan utama penelitian ini adalah apakah pendekatan antibodi generasi berikutnya yang tidak hanya bergantung pada RBD dapat lebih tahan terhadap penghindaran antibodi oleh varian SARS-CoV-2 yang menjadi perhatian
• Rubio dkk. mengarakterisasi aktivitas terhadap varian baru yang menjadi perhatian dari antibodi monoklonal spesifik NTD dan antibodi monoklonal spesifik RBD yang sebelumnya diisolasi dari pasien yang pulih dari COVID-19
• Antibodi spesifik NTD C1596 menunjukkan cakupan ikatan paling luas terhadap varian yang menjadi perhatian, dan berdasarkan temuan ini dirancang seri antibodi bispesifik CoV2-biRNs yang memiliki spesifisitas terhadap NTD dan RBD sekaligus
• CoV2-biRN5 dan CoV2-biRN7 mempertahankan aktivitas netralisasi in vitro yang kuat pada seluruh varian Omicron yang diuji, serta menunjukkan efektivitas lebih tinggi dibanding terapi antibodi induk tunggal maupun koktail
• Dalam percobaan pemberian profilaksis pada tikus, CoV2-biRN5 menurunkan beban virus di paru-paru setelah challenge XBB.1.5, menunjukkan potensi pendekatan kandidat ini juga pada model hewan

Penghindaran varian dan cakupan verifikasi

• Pada awal pandemi, terapi antibodi monoklonal sangat penting, tetapi kegunaannya menurun setelah munculnya varian yang menjadi perhatian
• Penghindaran antibodi oleh varian yang menjadi perhatian terutama terjadi melalui mutasi RBD pada protein spike, sehingga menonjolkan keterbatasan strategi target tunggal RBD
• C1596 mengenali epitope di luar site i antigenic supersite yang sudah dikenal pada NTD, sehingga dapat dimanfaatkan sebagai dasar desain untuk menghadapi penghindaran yang berpusat pada RBD
• Varian Omicron yang dikonfirmasi tetap mempertahankan aktivitas in vitro mencakup XBB.1.5, BA.2.86, dan JN.1
• Sebagai materi tambahan, tersedia Figs. S1~S11, Tables S1~S4 PDF, Data files S1~S3 ZIP, dan MDAR Reproducibility Checklist
• Makalah ini disediakan gratis sebagai layanan komunitas, tetapi akses penuh memerlukan login atau pembuatan akun gratis

[GN⁺]

Komentar di Hacker News

• Saya jadi teringat ketika hasil positif tes antibodi COVID tidak diakui sebagai bukti kekebalan yang sah.
  Saya bertanya-tanya apakah antibodi bispesifik seperti ini juga bisa dipakai untuk menetralkan protein spike yang dibuat tubuh akibat vaksin. Sejauh pemahaman saya, sel deltoid yang menjadi target adalah sel berumur panjang, sehingga bisa membuat dan melepaskan spike selama periode yang belum diketahui. Melihat munculnya berbagai booster spesifik, bisa dibayangkan juga orang mendapat antibodi penetral untuk menghindari stimulasi sistem imun yang terus-menerus.

  • Poin penting di sini adalah salah satu keunggulan vaksin mRNA ialah mRNA tidak bertahan lama di dalam sel [1].
    Jadi, meskipun selnya sendiri hidup lama, sel itu tidak akan lama membuat protein spike. Instruksi produksinya terurai dan tidak bisa lagi digunakan. Efek jangka panjang vaksin berasal dari respons sel B memori sistem imun terhadap protein spike yang diekspresikan secara singkat.
    [1] https://en.m.wikipedia.org/wiki/Messenger_RNA#Degradation

• Judulnya adalah “Bispecific antibodies targeting the N-terminal and receptor binding domains potently neutralize SARS-CoV-2 variants of concern”.
  Perlu dicatat bahwa antibodi ini membantu sebelum infeksi, tetapi “efikasi terapeutik setelah infeksi terbatas”. Dengan kata lain, ini bukan obat terapi. Selain itu, studi ini bukan pada manusia melainkan percobaan pada tikus, jadi lebih merupakan kemungkinan di masa depan, bukan sesuatu yang bisa dipakai sekarang.

  • dang, bisakah judul thread ini diubah? Judul lengkapnya terlalu panjang untuk HN, tetapi bisa dipersingkat menjadi kira-kira “Bispecific antibodies potently neutralize SARS-CoV-2 variants of concern”.

• Ini maksudnya apa? Apakah ini vaksin yang lebih baik?

  • Antibodi bukan vaksin. Antibodi mengikat antigen—dalam hal ini komponen virus—dan membuat sistem imun menyerang serta menghancurkan objek yang ditempeli antigen tersebut.
    Vaksin biasanya menyuntikkan antigen dalam jumlah besar agar pasien membentuk imunitas spesifik yang bereaksi cepat terhadap antigen tertentu. Dengan begitu, sistem imun mengembangkan sel B yang membuat antibodi terhadap antigen itu, dan tubuh menjadi semacam pabrik antibodi untuk merespons apa yang disuntikkan, tetapi ini butuh waktu. Menyuntikkan antibodi seperti dalam studi ini melewati proses alami pembentukan imunitas spesifik yang lambat. Antibodi dibuat dengan cara lain—di laboratorium atau pada hewan lain, misalnya—lalu disuntikkan langsung. Ini digunakan untuk penyakit berat, toksin berbahaya, atau orang dengan gangguan imun, ketika menunggu pasien membentuk imunitas spesifik sendiri terlalu lambat atau terlalu berisiko.
    Intinya, vaksin membuat tubuh mempertahankan kemampuan melawan infeksi serupa selama beberapa waktu, tetapi biasanya perlu beberapa minggu atau lebih untuk mencapai efek yang hampir penuh, dan kadang perlu beberapa kali dosis untuk meningkatkan efeknya. Untuk menangani orang yang sudah terinfeksi atau kemungkinan akan terinfeksi dalam beberapa hari, vaksin hanya bekerja baik pada penyakit yang sangat lambat seperti rabies, yang membutuhkan sekitar 1–2 bulan untuk mencapai sistem saraf pusat.
    Suntikan antibodi lebih mirip terapi sekali pakai yang harus diulang sampai hal buruk seperti virus atau toksin hilang. Ini umum dipakai untuk toksin, misalnya bisa laba-laba atau ular, dan kadang juga untuk penyakit berat seperti Ebola atau tetanus. Karena SARS-CoV-2 mendapat perhatian sangat besar, kini pendekatan ini juga sedang dicoba untuknya. Pada pasien yang tidak mengalami gangguan imun, penggunaan terapi antibodi untuk infeksi yang kurang mematikan bisa memberi waktu tambahan bagi sistem imun mereka sendiri untuk membuat antibodi sebelum gejala memburuk menjadi serius.
    Kesamaan kedua pendekatan ini adalah pada akhirnya antibodi mengikat protein virus corona. Bedanya adalah dari mana antibodi itu berasal, dan apakah tubuh bisa membuatnya lagi saat dibutuhkan. Vaksin seiring waktu mengarah ke imunitas alami, sedangkan terapi antibodi harus terus disuntikkan.
    Ini hanya penjelasan yang sangat kasar. Sistem imun sangat kompleks. Wikipedia atau buku biologi molekuler dan imunologi akan menjelaskannya jauh lebih rinci.
  • Ini lebih mirip Paxlovid yang lebih baik daripada vaksin yang lebih baik.
  • Ini bisa berarti munculnya mutasi baru. Varian semacam itu bisa muncul pada orang dengan gangguan imun yang mengalami infeksi kronis dan tidak bisa membersihkan infeksinya.
  • Mungkin pada akhirnya bisa begitu, dengan syarat riset dan pengembangan lanjutannya berjalan baik.
  • Ini tampaknya berada di ranah yang mirip dengan apa yang dulu disebut tidak pasti atau tidak efektif oleh pihak berkuasa, yaitu antibodi monoklonal. Pendekatan itu juga pernah diperlakukan seperti solusi homeopati ala teori konspirasi, tetapi ada hal-hal yang memang baru jelas seiring waktu.

• Semua varian? Namun N-terminal juga tidak kebal terhadap mutasi, dan antibodi tertentu bisa menciptakan tekanan seleksi evolusioner terhadap mutasi itu, sehingga mendorong kemunculan cepat varian baru.
  Cukup cari “N-Terminal” di https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8647783/.

• Menarik bahwa hampir semua makalah biologi di jurnal bagus atau jurnal papan atas memiliki gambar yang luar biasa bagus. Bahkan kalau diagram protein dikesampingkan, saya jadi penasaran seberapa besar usaha pembimbing untuk mengajari mahasiswa desain grafis.

  • Sebagai orang yang pernah bekerja sebagai peneliti sarjana dan peneliti pascasarjana di program bioteknologi top 3 di AS, mahasiswa menghabiskan waktu yang tidak masuk akal banyaknya untuk membuat gambar.
    Profesor di lab tempat saya bekerja mengatakan bahwa satu gambar yang estetis bisa menentukan apakah sebuah makalah diterima di Nature atau tidak. Kolaborator pada makalah itu adalah profesor terkenal yang sudah beberapa kali menerbitkan makalah di Nature, dan dari yang saya dengar, itu salah satu rahasianya.

• Ini juga patut diperhatikan karena pilihan politik baru-baru ini: tikus yang digunakan di sini adalah tikus manusiawi, jadi merupakan individu transgenik.
  Alih-alih gen ACE2 tikus, mereka memiliki gen ACE2 manusia, sehingga menghasilkan versi manusia dari enzim yang dipakai virus corona untuk masuk ke sel. Ini bukan bidang saya persis, jadi saya tidak yakin, tetapi saya ingat pernah mendengar bahwa semua model tikus untuk corona membutuhkan tikus transgenik.

  • Tidak ada masalah sama sekali dengan riset tikus transgenik.
    Sebagian kelompok pekan lalu mencoba mengklaim bahwa dalam pidato presiden AS, “transgenic” disamakan secara keliru dengan “trans(sexual|gender)”, tetapi itu salah. Faktanya memang ada riset yang didanai pemerintah terkait jenis kelamin/gender pada tikus [1,2].
    [1] https://www.whitehouse.gov/articles/2025/03/yes-biden-spent-...
    [2] Untuk memperjelas, saya tidak punya pendapat tentang riset ini dan tidak mengatakan itu pemborosan. Saya hanya menunjukkan bahwa seluruh meme “Trump keliru mengira transgenic itu transgender lol” tidak sesuai fakta, dan cukup ironis.

• Judulnya perlu tag [in mice].

  • Mungkin juga perlu tag [TRL x].
    Dengan suasana wacana online saat ini, komunitas HN bisa menjadi kandidat yang baik untuk membuat kumpulan tag bersama yang digunakan dan disempurnakan dari waktu ke waktu, guna memberi konteks pada judul postingan. Kalau bukan di judul, setidaknya bisa diletakkan di bagian atas atau komentar yang dipin. Akan lebih bagus lagi kalau bisa menyebar ke luar HN.