Craig Venter telah meninggal dunia

• J. Craig Venter, Ph.D. meninggal dunia pada 29 April 2026 di San Diego pada usia 79 tahun, setelah rawat inap singkat menyusul efek samping tak terduga yang muncul selama pengobatan kanker yang baru didiagnosis
• Sebagai pendiri, ketua dewan, dan CEO J. Craig Venter Institute, Venter membantu mendefinisikan genomika modern dan memengaruhi lahirnya biologi sintetis
• Di National Institutes of Health, ia memelopori penemuan gen berbasis expressed sequence tags(ESTs) dan memimpin publikasi sekuens draf pertama genom manusia serta genom manusia diploid berkualitas tinggi pertama
• Venter dan timnya membangun sel bakteri yang dapat bereplikasi sendiri pertama yang dikendalikan oleh genom hasil sintesis kimia, membuktikan bahwa genom dapat dirancang secara digital dan di-boot untuk menggerakkan sel hidup
• Melalui Sorcerer II Global Ocean Sampling Expedition, ia meneliti keanekaragaman mikroba laut dan melaporkan penemuan jutaan gen baru, serta ikut mendirikan Synthetic Genomics, Human Longevity, dan Diploid Genomics

---

Wafatnya dan pengumuman dari institusi

• J. Craig Venter, Ph.D. meninggal dunia pada 29 April 2026 di San Diego pada usia 79 tahun
• Penyebab kematiannya adalah efek samping tak terduga yang terjadi selama pengobatan kanker yang baru didiagnosis, dan ia wafat setelah rawat inap singkat
• Venter adalah pendiri, ketua dewan, dan CEO J. Craig Venter Institute
• Anders Dale, ketua JCVI, menyatakan bahwa Venter percaya sains maju dengan cara berpikir berbeda, bergerak tegas, dan menciptakan hal-hal yang belum ada
• JCVI menyatakan akan terus memajukan ilmu genom, mendukung investasi publik yang memungkinkan penemuan, dan melanjutkan kolaborasi luas untuk mengubah pengetahuan menjadi dampak nyata

Peran dalam genomika dan biologi sintetis

• Karya Venter membantu mendefinisikan genomika modern dan juga memengaruhi lahirnya bidang biologi sintetis
• Ia membangun tim lintas disiplin, mendorong ide-ide berani dan metode yang lebih cepat, serta menekankan prinsip bahwa penemuan harus menghasilkan dampak di dunia nyata
• Ia mendukung anggaran sains federal yang kuat dan kolaborasi yang mempercepat kemajuan di pemerintah, akademisi, dan industri
• Sepanjang kariernya, ia membantu mengubah genomika dari pendekatan penemuan gen per gen yang lambat menjadi sains berbasis data yang dapat diskalakan
• Setelah itu, ia memperluas riset hingga tahap membuktikan bahwa genom dapat dirancang dan dibangun

Pencapaian ilmiah utama

• Penemuan gen melalui EST

  • Di National Institutes of Health, ia membantu memelopori penemuan gen dengan memanfaatkan expressed sequence tags(ESTs)
  • Pendekatan EST memungkinkan identifikasi cepat sejumlah besar gen manusia dan mempercepat upaya pemetaan genom

• Draf genom manusia dan genom diploid

  • Ia memimpin pekerjaan yang menghasilkan sekuens draf pertama genom manusia, membuka jalan bagi biologi memasuki era digital
  • Setelah itu, bersama rekan-rekannya, ia menerbitkan genom manusia diploid berkualitas tinggi pertama
  • Pencapaian ini menegaskan pentingnya menangkap variasi genetik yang diwariskan dari kedua orang tua

• Sel yang digerakkan oleh genom sintetis

  • Venter dan timnya membangun sel bakteri yang dapat bereplikasi sendiri pertama yang dikendalikan oleh genom hasil sintesis kimia
  • Pencapaian ini membuktikan bahwa genom dapat dirancang secara digital, dibuat dari komponen kimia, dan “di-boot” untuk menggerakkan sel hidup

• Survei keanekaragaman mikroba laut

  • Melalui Sorcerer II Global Ocean Sampling Expedition, ia meneliti keanekaragaman mikroba laut yang luas dengan metagenomika
  • Ia melaporkan penemuan jutaan gen baru dan memperluas cakupan keluarga protein yang telah dikenal
  • Pekerjaan ini memperluas pemahaman tentang mikrobioma laut dan perannya dalam sistem planet

Membangun institusi dan perusahaan

• Venter juga merupakan sosok yang membangun tim, platform, dan institusi yang dirancang untuk menangani tantangan ilmiah besar
• Ia mendirikan J. Craig Venter Institute dan membangun fondasi kelembagaan untuk riset genomika dan biologi sintetis
• Sebagai wirausahawan serial, ia ikut mendirikan Synthetic Genomics, Inc., Human Longevity, Inc., dan Diploid Genomics, Inc.
• Aktivitas perusahaan-perusahaan ini berlanjut sebagai upaya mengubah genomika dan biologi sintetis menjadi alat bagi kesehatan dan masyarakat

Ringkasan JCVI dan langkah selanjutnya

• JCVI adalah lembaga riset nirlaba yang berlokasi di Rockville, Maryland dan La Jolla, California
• JCVI berfokus pada kemajuan genomika, pemahaman implikasi sosialnya, serta penyampaian hasil riset kepada komunitas ilmiah, publik, dan pembuat kebijakan
• Sekitar 120 ilmuwan dan staf bekerja di bidang biologi sintetis, biologi manusia dan evolusi, genetika, bioinformatika/informatika, teknologi informasi, DNA sequencing throughput tinggi, riset kebijakan genom dan lingkungan, serta edukasi publik sains dan kebijakan sains
• JCVI adalah organisasi 501(c)(3)
• Institut tersebut meminta penghormatan atas privasi keluarga Venter, dan informasi tambahan terkait penghormatan akan dibagikan bila memungkinkan

[GN⁺]

Komentar Hacker News

• Saya pernah balapan dengannya di kapal yang sama. Suatu kali saat melakukan jibe dia tersapu ke laut, dan mainsheet melilit tubuhnya
  Saat terseret ke dalam air, entah bagaimana dia tetap berpegangan pada pagar kapal, dan saya bisa menarik bagian loop pada pakaian pelampungnya lalu mengangkatnya kembali ke atas kapal
  Dia orang yang menarik, pernah bertugas sebagai medis tempur dalam Perang Vietnam, dan kapal lamanya Sorcerer II menjadi platform untuk Global Ocean Sampling Expedition pada 2003~2010, yang menemukan jutaan gen mikroba laut baru
  Dia punya banyak teman dan juga cukup banyak musuh, tetapi tampaknya dia menjalani kehidupan manusia yang utuh di bumi dengan caranya sendiri yang aneh namun menakjubkan

  • Baru 79 tahun, itu terlalu singkat untuk disebut pengalaman manusia yang utuh. Sangat menyedihkan bahwa terutama orang-orang paling luar biasa selalu diberi waktu yang terlalu sedikit di sini

• Waktu kecil saya menonton wawancaranya di 60 Minutes. Dia bilang pernah melepaskan mimpi menjadi perenang Olimpiade, keluar dari kuliah, lalu bertugas sebagai medis tempur di Vietnam, dan pernah mencoba bunuh diri dengan melompat dari kapal Angkatan Laut, tetapi selamat karena dia nyaris atlet tingkat Olimpiade
  Belakangan saya benar-benar melihatnya berbicara tentang genom manusia di Cornell University bersama teman lamanya, ahli genetika Andy Clark; dia tinggi, sangat berwibawa, dan botak
  Beberapa tahun kemudian saya pindah ke San Diego dan mulai berselancar, lalu saat membuka situs web surfing, tiba-tiba Craig Venter muncul dalam iklan jam mewah. Dia sedang berlayar di laut sambil memakai jam Jaeger-LeCoultre yang mungkin lebih mahal daripada biaya hidup saya saat sekolah pascasarjana waktu itu
  Beberapa tahun setelahnya saya wawancara di salah satu perusahaannya, Synthetic Genomics, dan tim bioinformatikanya terlihat kewalahan karena perusahaan terlalu sering ganti arah. Mereka berpindah dari produksi biofuel ke rekayasa genetika babi agar bisa menghasilkan ginjal yang dapat ditransplantasikan ke manusia, dan dalam beberapa tahun ide itu benar-benar mulai berhasil
  Pada akhirnya, Venter dan pencapaiannya seperti menjadi latar belakang seluruh karier dewasa saya, yaitu biologi, genetika, bioinformatika, dan machine learning. Untuk mewujudkan sains hebat menjadi kenyataan, kadang memang dibutuhkan tokoh dengan kepribadian yang luar biasa dominan

  • Cerita-cerita yang bagus. Saya pernah bertanya soal urusan babi itu setelah dia beralih dari biofuel. Seingat saya dia mengumpulkan 150 juta dolar dari Exxon
    Kalau ingatan saya benar, dia bekerja sama dengan Martin, pendiri yang terkenal kontroversial di balik SeriusXM dan United Therapeutics, yang sekarang bernama Martine Rothblatt

• Ironisnya, dia menghabiskan beberapa tahun terakhir hidupnya untuk perpanjangan umur[1], dan menjual konsultasi “layanan medis proaktif” seharga 25.000 dolar kepada orang-orang yang mampu membayarnya[2]
  1: situs web perusahaan humanlongevity dot com tampaknya telah disusupi, dan mencoba mendorong pemasangan trojan dengan dalih “captcha”, jadi sebagai gantinya saya taruh halaman Wikipedia: https://en.wikipedia.org/wiki/Human_Longevity
  2: https://fortune.com/2017/02/21/craig-venter-human-longevity/

  • Dia mengidap kanker, dan tampaknya sesuatu yang berkaitan dengan pengobatannya menjadi penyebab kematiannya

• Craig Venter terkenal karena keterlibatannya dalam Human Genome Project. Dia mengumumkan draf pertama genom manusia bersama Presiden Clinton dan Francis Collins

  • “Keterlibatan” di sini lebih berarti mengambil data publik lalu menambahkan sejumlah kecil data privat yang mereka buat sendiri untuk mencoba mendapatkan perakitan pertama
    Para ilmuwan Human Genome Project mengira dia ingin mematenkan keseluruhannya agar orang lain harus membayar. Saat itu belum jelas apa yang bisa dan tidak bisa dipatenkan
    Jadi keterlibatannya adalah memicu proyek publik itu untuk ikut dalam perlombaan perakitan genom, yang merupakan masalah komputasi besar yang sepenuhnya belum direncanakan pihak publik
    https://archive.is/2022.02.14-091753/https://www.nytimes.com...
  • Bisa juga dibilang dia sendiri adalah Human Genome Project. Setahu saya dia memastikan salah satu sampelnya adalah dirinya sendiri

• Dia adalah wirausahawan sekaligus penemu yang cukup mengguncang, dalam arti positif, di bidang yang saat itu didominasi ilmuwan yang sangat berhati-hati
  Tentu para ilmuwan itu juga hebat, tetapi tampaknya kecil kemungkinan genom akan berhasil diurutkan dalam 10~20 tahun sejak saat dia melakukannya. Secara budaya, dia seperti menjalankan Apollo Project di bidang yang lebih mirip NASA tahun 1980-an

  • Setahu saya Hamilton Smith yang mendorong bahwa shotgun sequencing akan berhasil
    Pihak NIH tetap bersikeras pada primer walking sampai Celera merakit genom terlalu cepat, lalu NIH pun harus ikut beralih ke metode shotgun
  • Saya kuliah S1 biologi, dan salah satu profesor saya terlibat dalam pekerjaan ini. Profesor itu sangat menekankan bahwa Human Genome Project selesai lebih dulu daripada Celera, dan bahwa pendekatan shotgun tim Venter pada dasarnya bergantung pada data referensi yang dirilis terbuka oleh HGP agar bisa berhasil

• Turut berduka atas wafatnya Craig Venter
  Saya ingat pernah mendengar tentang Human Genome Project saat kelas 5 SD. Waktu itu diperkenalkan sebagai upaya yang radikal
  Sekarang 30 tahun kemudian, lihatlah sejauh apa kita sudah melangkah. Beberapa hari lalu saya membaca tentang kebocoran UK Biobank(https://news.ycombinator.com/item?id=47875843), yang menyebutkan bahwa sejumlah besar genom manusia lengkap ikut bocor. Rasanya orang dulu benar-benar melihat Craig Venter sebagai seseorang yang jauh melampaui zamannya

• Kabar yang menyedihkan. Saya mungkin bertemu Craig sangat singkat di sebuah konferensi sekitar 10 tahun lalu
  Saat itu saya nyaris belajar genetika secara otodidak, jadi jelas bukan selevel Craig, tetapi dia sangat aktif dalam percakapan dan meluangkan waktu untuk berbicara dengan penuh perhatian

• Dia sosok yang egosentris pada skala dunia, mungkin bahkan kosmik, dan menerbitkan urutan genom manusia diploid pertama. Itu adalah DNA miliknya sendiri
  Dia tidak berhenti pada mengumumkan pencapaian itu kepada audiens manusia. Dia berkata, “Sejak genom saya diurutkan, perangkat lunak saya telah dipancarkan ke luar angkasa dalam bentuk gelombang elektromagnetik, membawa informasi genetik saya jauh melampaui bumi”

• Ada kutipan menarik darinya
  “
  SPIEGEL: Jadi Anda tidak menganggap Collins sebagai ilmuwan sejati?
  Venter: Anggap saja dia administrator pemerintah
  ”
  https://www.science.org/content/blog-post/craig-venter-venti...

• Saat urutan genom lengkap diumumkan, saya sedang magang di bidang biologi molekuler. Laboratorium kami punya thermal cycler, dan kami harus memesan waktu pemakaian di jadwal kertas
  Saya ingat fotonya berdiri di depan deretan rak yang padat berisi thermal cycler. Dia mengajarkan satu hal tentang skala, dan membuktikan bahwa kadang ada gunanya melihat apa yang kita punya sekarang lalu bertanya, “bagaimana kalau ini diperbesar 200 kali?”
  Dalam perangkat lunak, kalau memikirkan hal seperti array GPU, ini mungkin terdengar wajar, tetapi bagi orang yang terbiasa dengan wet lab dan jadwal pemesanan alat di kertas, ceritanya berbeda. Rasanya di ilmu hayati pun mungkin akan ada lebih banyak terobosan jika sesekali kita bisa memakai eskalasi skala secara brutal

  • Saya seorang ahli statistik dan istri saya bekerja di ilmu biologi dasar. Setiap kali istri saya meminta saran tentang eksperimen, saya hampir selalu ingin bilang agar ukuran sampelnya diperbesar 10 kali
    Tetapi di dunia akademik ada anggapan baku tentang seberapa besar ukuran sampel seharusnya, dan kalau mencoba memakai sampel yang jauh lebih besar, akan langsung terbentur banyak hambatan, dari etika percobaan hewan sampai pendanaan penelitian
    Pada akhirnya ada batas pada apa yang bisa dipelajari dari ukuran sampel 12. Saya tidak yakin menghabiskan banyak eksperimen tikus dengan 12 ekor yang tidak menghasilkan apa-apa itu lebih etis daripada memakai 100 ekor dan benar-benar mendapatkan daya uji statistik untuk mengidentifikasi lebih dari sekadar ukuran efek yang paling besar
  • Saya bekerja di bidang otomasi laboratorium, dan kita memang sudah melangkah sangat jauh dari jadwal kertas. Meski begitu, jadwal seperti itu masih cukup banyak dipakai :)