AlphaFold - Solusi untuk masalah pelipatan protein

• Model jaringan saraf yang dikembangkan oleh DeepMind untuk menyelesaikan masalah pelipatan protein

Masalah pelipatan protein

• Protein adalah struktur kompleks yang tersusun dari asam amino yang terhubung dalam bentuk rantai lalu terlipat secara tiga dimensi

• Bergantung pada asam amino penyusun protein dan struktur lipatannya, protein menjalankan berbagai fungsi

• Namun, sangat sulit memprediksi struktur protein hanya dari susunan asam aminonya

AlphaFold

• Dilatih menggunakan sekitar 170.000 data struktur protein dari Protein Data Bank serta data protein lain yang strukturnya belum diketahui

• Dilatih selama beberapa minggu menggunakan sekitar 128 core TPUv3

CASP(Critical Assessment of protein Structure Prediction)

• Kompetisi prediksi struktur protein dunia yang pertama kali diadakan pada 1994 dan berlangsung setiap dua tahun

• Memprediksi struktur protein yang strukturnya masih belum diketahui

• Versi awal AlphaFold berpartisipasi dalam CASP13 yang diadakan pada 2018

• Pada CASP14 yang diadakan pada 2020, AlphaFold meraih peringkat pertama dengan rata-rata GDT 92,4

• Ini setara dengan tingkat kesalahan sekitar selebar 1 atom

Dampak yang diharapkan dan prospek

• Tahun ini AlphaFold memprediksi protein coronavirus seperti ORF3a dan ORF8

• Ke depannya, diharapkan dapat berkontribusi pada penyelesaian berbagai masalah biologis dan pengembangan obat baru

[ffdd270]

Sepertinya memang harus menjaga kesehatan dengan baik. Sampai mimpi memperpanjang usia benar-benar terwujud... Ada terlalu banyak hal yang ingin saya lakukan di kehidupan ini ;m;

[xguru]

Katanya ada artikel yang membahas penggunaan protein untuk membalikkan penuaan sel.

Mungkin kecerdasan buatan akan memainkan peran besar dalam mewujudkan impian memperpanjang umur.

Muncul teknologi 'pembalikan penuaan sel' yang membuat sel kulit yang menua menjadi muda kembali

http://m.dongascience.donga.com/news.php?idx=41855

Sebagai strategi untuk membalikkan penuaan sel, teknologi 'dediferensiasi' adalah yang paling banyak diteliti. Dediferensiasi adalah teknologi yang menambahkan empat jenis protein yang disebut 'faktor transkripsi Yamanaka' ke sel yang telah berkembang menjadi jaringan tubuh tertentu seperti sel kulit, lalu mengembalikannya ke kondisi muda sebelum berdiferensiasi menjadi sel tertentu.